1、程序差异—传统会计采用的主要财务分析程序处理方法是记账凭证、汇总记账、科目汇总、日记账核算等核算形式，由于企业的经营模式、管理方式和生产规模的不同，财务核算形式也会复杂多变；对业务的数据收集上，由于划分详细，存在重复操作的弊端，传统会计的财务管理程序详细有针对性，但是手续繁杂，效率无法得到保障。计算机会计在传统会计的基础上简化了财务核算形式，以文件设置和计算机操作便捷的优势，一般用日记账和凭证核算的财务审核形式，就能覆盖不同企业经济活动的财务审核需要。计算机会计财务审核的简便保障了会计的效率，但是在具体问题具体分析的财务实践中有待完善。

        2、科目差异—传统会计在科目设置上习惯性的采用三级账户的明细账和总账来设置账户，传统会计受到手工核算的限制，科目的设置只有中文科目。计算机会计的科目设置摆脱了形式的局限性，通过信息技术的应用，能有序的完成复杂的账目审核工作，因此，计算机会计在科目设置上，更加的详细合理，计算机会计的科目设置一般采用六级或六级以上的明细账，只要根据计算机会计的软件的差异和财务账目的需求，计算机会计的科目设置比传统会计的科目设置更加的细致、详尽。在计算机会计科目设置的操作工程中，也可以根据财务审核的不同需要进行调整和变动，极大提高了会计人员的工作效率。

        3、系统差异—受到物质形式和操作方法的限制，传统会计的系统基础设置较为单一，一般是开设总账、设置科目、余额审核等，会计的基础系统设置关系到后期的分工合作的效率和具体工作形式。计算机会计的基础系统组建复杂而详细，计算机的便捷操作和软件的不断更新，计算机会计能根据企业的管理形式、发展需要和生产规模进行详细的分类设置，为会计的后续工作奠定良好的基础。

        传统会计和计算机会计都有其独特的优势和不可避免的缺陷，在企业经济活动中，一般会采取两种会计模式相结合的方式，便于日常的财务管理。